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自體免疫疾病，正常情況下，免疫細胞是認得出自己人的，不會對自身組織器官產生攻擊，但當機體受內外因素或遺傳因素影響時，免疫系統就失調了，換句話說，就是自己的免疫系統產生抗體而攻擊自身的健康細胞，不僅對自身成份發生免疫反應，還會導致組織器官受損甚至導致功能障礙。常見的自體免疫疾病包括：一型糖尿病、紅斑性狼瘡、類風濕性關節炎、多發性硬化症、甲狀腺機能抗進、重症肌無力等等，臨床上目前的治療主要是用類固醇、免疫抑制劑或症狀治療的抗發炎藥物，這些治療均在一定程度上能控制疾病的進展，但仍有部分患者療效欠佳，而且免疫抑制初也抑制了患者所有免疫功能，副作用較大，需終生治療。